Im Jahr 1886 übernimmt die Familie Locher die Brauerei im Appenzell, die noch heute Destillerie und Brauerei ist. Als im Jahre 1999 das Verbot für die Herstellung von Spirituosen aus Getreide aufgehoben wurde, entschied sich Braumeister Karl Locher mit Herstellung des Säntis Malt zu beginnen. 2002 kommt der erste Säntis Malt auf den Markt somit gilt die Brauerei Locher als Vorreiter für die Whisky-Herstellung in der Schweiz.
Im Jahre 2011 wird die Brauerei Locher vom Whisky Guide zur «Whisky Distillery 2011» gewählt.